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细菌基因组重测序 ——比对准确、高通量、高效快速

细菌基于高通量测序数据,与近缘参考基因组进行比对,进行变异检测的方法即为细菌基因组重测序。通过重测序可以获得目标基因组对于参考基因组的 SNP、InDel、SV等一系列变异信息,从中尝试对基因组之间的性?#24202;?#24322;进行解析,或作为标记进行大规模的进化分析。目前,可以利用二代和三代测序平台对细菌基因组进行研究。二代测序平台通量高、成本低,可以经济快捷的获得大量菌株的基本信息,但是二代测序的读长有限,无法获得基因组的完整信息;而三代测序技术读长较二代测序有了质的飞跃,可以获得细菌基因组的完成图。

 

Technological process

技术流程

Sample requirements

样本要求

  •                            

    DNA样品

    总量:

    ≥ 3.0μg

    浓度:

    ≥ 30ng/μL

BIOINFORMATIC ANALYSIS

生信分析

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